Ha pienamente convinto e sarà ai nastri di partenza anche la prossima stagione. Il Milan ha scelto di riscattare Cristian Zapata, lo ha confidato Adriano Galliani a Milan Channel al termine della sfida pareggiata con la Roma: "Zapata e Mexes formano una coppia molto buona che sarà riconfermata per la prossima stagione". Ancora non è stata comunicata la cifra pagata per il difensore colombiano classe 1986, ma secondo indiscrezioni il Milan ha ottenuto uno sconto dal Villarreal e non pagherà i sei milioni di euro previsti per il riscatto.

Arrivato per sostituire, numericamente, Thiago Silva, Zapata ha avuto un inizio di stagione traumatico, figlio dell'annata da dimenticare in Spagna con il submarino amarillo, ma da gennaio in poi ha cambiato marcia, prendendosi la maglia da titolare e non lasciandola più, merito di una crescita prima di tutto mentale, che l'ha fatto tornare quel giocatore ammirato ai tempi dell'Udinese. Con Yepes in partenza per giocare con maggiore continuità, toccherà a Zapata fare da chioccia a Jherson Vergara, 20enne centrale colombiano che Galliani ha strappato all'Universitario Popayàn